aVANCÉES EN BIOLOGIE DES SYSTÈMES ET DE SYNTHÈSE
Modélisation de systèmes biologiques complexes dans le contexte de la génomique
École Thématique de Recherche
    Du 13 au 17 mars 2017, Lyon  
INRIA INSA-Lyon

PROGRAMME

Lundi 21 mars 2017 - Interactions cellule-cellule: Biologie des Systèmes Dynamiques & Consortia

08h30 - 08h45 Accueil
08h45 - 09h00 Présentation de l'École Thématique
09h00 - 10h30 Noisy and dynamic gene regulation at the single cell level
  James LOCKE, Sainsbury Laboratory Cambridge, University of Cambridge, UK
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Dynamics and evolution of metabolic interactions in microbial ecosystems
  Daniel SEGRÉ, Dynamics and evolution of biochemical networks, Boston U., US
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 16h00 Présentations étudiants (I)
16h00 - 16h30 Pause
16h30 - 18h00 Présentations étudiants (II)
18h00 - 19h30 Séance Posters
20h00 - 21h00 Dîner
21h00 - 22h00 Séance Posters

Mardi 14 mars 2017 - Interactions cellule-cellule: Biologie de synthèse des communications cellule-cellule & Transduction mécanique des tissus

09h00 - 09h10 Hommage in memoriam René Thomas
  Marcelline KAUFMAN
09h10 - 10h40 Synthetic cell-cell communications mimicking multicellular development
  Miki EBISUYA, Lab. for Reconstitutive Developmental Biology, RIKEN Quantitative Biology Center, Kobe, JP
10h40 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Synthetic Biology and Biofabrication for Conveyance of Molecular Communication
  William E. BENTLEY, Fishell Inst. of biomedical devices, U. Maryland, US
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 16h30 Atelier : reconstruction des réseaux métaboliques
  Claudine MEDIGUE & David VALLENET, UMR 8030 CEA/Genoscope - CNRS - Univ. Évry, F
16h30 - 17h00 Pause
17h00 - 19h00 Atelier : Simulations Entité-centrée
  Patrick AMAR, Sys2Diag, CNRS / LRI, Univ. Paris-Sud, F
19h30 - 20h30 Dîner

Mercredi 15 mars 2017 - Interactions cellule-cellule: Microbiome

09h00 - 10h30 In silico and in vitro analysis of resource allocation in biofilm consortia
  Ross CARLSON, Center for biofilm engineering, Montana State U., Bozeman, US
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Understanding functions and interactions of plant microbiomes
  Gabriele BERG, Institute of Environmental Biotechnology (Head), TU Graz, AT
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 17h30 Atelier : modélisation du métabolisme (I)
  Jean-Pierre MAZAT, Univ. Bordeaux 2, F
14h30 - 16h30 Atelier : Détecter des régularités dans le génome avec GREAT
  Costas BOUYIOUKOS, Epigenetics and cell fate, Univ Paris-Diderot, F
17h30 - 19h30 Temps libre
19h30 - 20h30 Dîner

Jeudi 16 mars 2017 - Métabolisme en relation avec les interactions cellule-cellule & Approches Calculatoires

09h00 - 10h30 Kinetic Modeling of Liver Metabolism
  Hermann-Georg HOLZHUTTER, Inst. of Biochemistry, Charité-Universitätsmedizin Berlin, DE
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Petri nets for modeling biochemical systems
  Ina KOCH, Molecular Bioinformatics, Goethe U. Frankfurt, DE
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour
14h30 - 16h30 Atelier : Approches Logiques
  Gilles BERNOT, I3S, Univ. Nice, F
14h30 - 16h30 Atelier : FindPath et RetroPath: Des solutions pour la conception in silico de voies métaboliques
  Pablo CARBONELL & Stéphanie HEUX, iSSB, Evry, F & Synbiochem, Univ. Manchester, UK and LISBP, INSA Toulouse, F
16h30 - 17h00 Pause
16h15 - 19h15 Atelier : modélisation du métabolisme (II)
  Jean-Pierre MAZAT, Univ. Bordeaux 2, F
17h00 - 19h00 Atelier : Conception de réseaux artificiels de régulation de gènes par une approche "logique floue"
  Morgan MADEC, Telecom Physique Strasbourg, Illkirch, F
19h30 - 21h00 Dîner
21h00 - 22h00 New Mediums of Life
  Orkan TELHAN, School of Design, U. of Pennsylvania, Philadelphia, US

Vendredi 17 mars 2017 - Métabolisme en relation avec les interactions cellule-cellule

09h00 - 10h30 Metabolic flexibility of pancreatic cancer
  Sophie VASSEUR, Centre de recherche en Cancérologie de Marseille, Marseille, FR
10h30 - 11h00 Pause
11h00 - 12h30 Classifying tumours by RNA expression patterns: Hallmarks, signalling pathways and metabolic pathways across cancers
  Elke K. MARKERT, Integrative Cancer Metabolism, Inst. of Cancer Sciences, U. Glasgow, UK
12h30 - 14h00 Déjeuner
14h00 - 14h30 Discussions avec les orateurs du jour